近日,学院韩毛振课题组在《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》发表了“Comprehensive analysis of 84 Faecalibacterium prausnitzii strains uncovers their genetic diversity, functional characteristics, and potential risks”的研究论文。
普拉梭菌是一种有益的人类肠道微生物,也是下一代益生菌的候选者。随着益生菌现在用于临床治疗,需要考虑其安全性和副作用。因此,有必要全面了解不同普拉梭菌菌株的遗传多样性、功能特征和潜在风险。在本研究中,我们收集了84 F 的遗传信息。prausnitzii菌株致力于从多个角度进行泛基因组分析。基于单拷贝基因、16S rRNA序列和泛基因组组成,对F. prausnitzii进行不同系统发育分析对菌株进行了分析,显示了它们之间的遗传多样性。在泛基因组的蛋白质中,我们发现辅助簇对普拉梭菌菌株的主要遗传功能的贡献比核心簇和特定簇更大。F. prausnitzii的功能注释表明,只有极少数蛋白质与人类疾病相关,并且不存在编码有害产物的次生代谢基因簇。同时,在F. prausnitzii中检测到完整的脂肪酸代谢。此外,我们还检测了有害元素,包括抗生素抗性基因、毒力因子和致病基因,并提出了益生菌潜在风险指数(PPRI)和益生菌潜在风险评分(PPRS),将这84株菌株分为低、中、和高危人群。最终,15株菌株被鉴定为低风险菌株,优先进入临床应用。毫无疑问,我们的结果提供了对普拉梭菌的全面了解和见解,PPRI和PPRS可用于总体评估益生菌的潜在风险并指导益生菌在临床应用中的应用。
原文链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2022.919701/full