个人简介

2019.01-至今        元码基因科技（北京）股份有限公司，副总经理

2018.03-2018.12  西奈山伊坎医学院，高级研究科学家

2013.07-2018.02  西奈山伊坎医学院，博士后研究员

2011.07-2013.06  密西西比州立大学，博士后研究员

200908-2011.06   中国科学院，助理研究员

2003.08-2009.07  新加坡国立大学，博士

2000.01-2003.07  大连理工大学，硕士

1996.09-2000.07  大连理工大学，学士

个人荣誉

2013-2018：美国 Berg  和 Unity Biotech  制药公司博士后基金 

2003-2007:  新加坡国立大学研究奖学金 

2000:           大连市优秀毕业生 

1999:           创维杯大学生数学建模竞赛全国二等奖, 辽宁赛区一等奖

1. 癌症的早期筛查. 诊断和组织溯源　　

2. 医学图像处理. 机器学习. 生物进化. 大数据挖掘以及生物统计学方法研究　　

3. 单细胞 RNA  测序分析及其在衰老和癌症中的应用　　

4. 关于抗衰老和抗癌药物的生物信息和系统生物学方法研究

1. Yang J, Grünewald S, Wan XF. Quartet-net: a quartet-based method to reconstruct phylogenetic networks. Mol. Biol. Evol., 2013;30(5):1206-1217.

2. Yang J, Zhang L. On counting tandem duplication trees. Mol. Biol. Evol., 2004;21(6):1160-1163. 

3. Sun H, Yang J (共一), Zhang T, et al. Using sequence data to infer the antigenicity of influenza virus. mBio., 2013;4(4):e00230-13. 

4. Sun H#, Yang J#, Zhang T, Long LP, Jia K, Y ang G, Webby RJ, Wan XF. Using sequence data to infer the antigenicity of influenza virus. MBio., 2013;4(4): e00230-13. 5. Xu X, Long H, Xi B, Ji B, Li Z, Dang Y, Jiang C, Yao Y, Yang J. Molecular Network-Based Drug Prediction in Thyroid Cancer. Int. J. Mol. Sci., 2019;20(2):263.

6. Peng L, Tian X, Tian G, Xu J, Huang X, Weng Y, Yang J, Zhou L. Single-cell RNA-seq clustering: datasets, models, and algorithms. RNA Biol., 2020;17(6):765-783.

7. Huang L, Li X, Guo P, Yao Y, Liao B, Zhang W, Wang F, Yang J, Zhao Y, Sun H, He P, Yang J. Matrix completion with side information and its applications in predicting the antigenicity of influenza viruses. Bioinformatics., 2017;33(20):3195-3201.

8. Zhu L, Zhang J, Zhang Y, Lang J, Xiang J, Bai X, Yan N, Tian G, Zhang H, Yang J. NAIGO: An Improved Method to Align PPI Networks Based on Gene Ontology and Graphlets. Front. Bioeng. Biotechnol., 2020;8:547.

9. Yang J, Liao B, Zhang T, Xu Y. Editorial: Bioinformatics Analysis of Single Cell Sequencing Data and Applications in Precision Medicine. Front. Genet., 2020;10:1358.

10. Wang L, Wang Y, Li H, Feng X, Yuan D, Yang J. A Bidirectional Label Propagation Based Computational Model for Potential Microbe-Disease Association Prediction. Front. Microbiol., 2019;10:684.

1. 湖南省自然科学基金面上项目，2018JJ2461，利用大数据挖掘研究衰老、老年性疾病和抗衰老药物， 2018.01-2020.12，主持；

2. 国家自然科学基金面上项目，31171218，建立基于混合人群的基因相互作用研究策略：新疆典型混合人群的全基因组研究，2012.01月-2015.12，参与；

3. 国家自然科学基金面上项目，31171279，基于群体基因组序列的人类群体遗传结构调查新方法的研究，2012.01月-2015.12， 参与；

4. 美国国立卫生院，1RC1AI086830-01，Predicting of influenza antigenic variants using a novel sparse multitask learnin ，2010.08 -2012.08，参与；

5. 美国司法部， 2010-DD-BX-0596，Bio-defense Research on Attenuation of New Pathogenic Strains，2010.08-2011.08，参与。